به کارگیری یک روش حساسrt-nested pcr برای تشخیص ویروس هپاتیت c

Authors

kiana shahzamani

department of virology, school of medical sciences, tarbiat modares university, tehran, iran farzaneh sabahi

department of virology, school of medical sciences, tarbiat modares university, tehran, iran shahin merat

digestive disease center, shariati hospital, medical sciences university of tehran, tehran, iran houri rezvan

iranian blood transfusion organization/ research center, tehran, iran siamak mirab samiee

abstract

هدف: ویروس هپاتیت cیکی از مهمترین عوامل ایجاد کننده هپاتیت ویروسی به شمار می رود و تشخیص آن در نمونه های مشکوک از اهمیت بالایی برخوردار است. خطر انتقال عفونت ویروسی از طریق تزریق خون و فرآورده های آن ناشی از نقص روش های غربالگری سرولوژیک در تشخیص اهداکنندگان آلوده ای است که در دوره پنجره بیماری هستند. بنابراین تشخیص دقیق و به موقع عفونت hcvپیش از ظهور آنتی بادی در بدن فرد آلوده از اهمیت ویژه ای برخوردار است. تشخیص ژنوم ویروس hcv در نمونه های مشکوک، از گسترش بیماری و شیوع روزافزون آن جلوگیری خواهد نمود. با استفاده از این روش که مبتنی بر شناسایی اسید نوکلئیک ویروس است، می توان عفونت را در مراحل ابتدایی و قبل از ظهور آنتی بادی های اختصاصی تشخیص داد. هدف از این پژوهش طراحی روش بسیار حساس و دقیق rt-nested pcr برای تشخیص عفونت hcv است. مواد و روش ها: روش rt-nested pcr به منظور جداسازی توالی حفاظت شده از ناحیه 5' utr راه اندازی و به کار برده شد. ابتدا با استفاده از روش ترانس کریپتاز معکوس، سنتز cdna از روی rnaژنوم ویروس صورت گرفت. پس از آن با روش nested pcr با استفاده دو جفت آغازگر اختصاصی و طی دو مرحله، قطعه مورد نظر تکثیر شد. محـصولات pcr به کـمک روش الـکتروفورز بررسی و همچنین از کیت تجاری rt-pcr یک مرحله ای برای مقایسه با نتایج حاصل از روش طراحی شده استفاده شد. نتایج: تعداد 25 نمونه پلاسمای بیماران hcv مثبت که توسط روش های الایزا و وسترن بلات مثبت قطعی تشخیص داده شده بودند به عنوان نمونه های مثبت، رقت های مختلف از یک نمونه بیمار با تیتر بالا به عنوان استاندارد و 25 نمونه پلاسمای منفی متعلق به اهداکنندگان خون سالم به عنوان کنترل منفی جمع آوری شده با این روش بررسی شد. در تمام موارد مثبت، باند مورد نظر روی ژل آگارز مشاهده شد. با توجه به این که در هیچ یک از نمونه های منفی باند مزبور ملاحظه نشد، مقایسه نتایج حاصل از روش طراحی شده با روش تجاری موجود همبستگی خوبی را نشان داد. نتیجه گیری: بر اساس نتایج به دست آمده در این مطالعه، مشخص شد که روش راه اندازی شده در تشخیص عفونت hcv از حساسیت و اختصاصیت بالایی برخوردار است. همچنین با توجه به حساسیت این روش، به نظر می رسد که می توان ژنوم ویروس را پیش از تغییرات سرمی و ظهور آنتی بادی ها تشخیص داد و از این رو می توان دوره پنجره را کوتاه تر نمود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

راه‌اندازی روش RT-Nested PCR به منظور تشخیص ویروس نقص ایمنی اکتسابی تیپ یک

  چکید ه   سابقه و هدف   ویروس نقص ایمنی اکتسابی تیپ یک( HIV-1 ) عامل ایجاد کننده سندرم نقص ایمنی اکتسابی انسانی”ایدز” می‌باشد. انتقال بیماری از طریق انتقال خون در دوره پنجره، در مراکز انتقال خون یک معضل جهانی محسوب می‌شود. علاوه بر این، نیاز مبرمی برای تشخیص سریع، حساس و دقیق عفونت HIV-1 قبل از ظهور آنتی‌بادی در بدن فرد آلوده در بیمارستان‌ها و مراکز بهداشتی احساس می‌شود. تشخیص ژنوم ویروس HIV-1...

full text

استفاده از روش Nested-PCR ‌برای تشخیص آلودگی کشت‌های سلولی به ویروس pestivirus

در این مطالعه یک روش Nested-PCR ‌برای تشخیص دو ویروس BVDV ‌از سویه NADL ‌بهینه سازی گردید. در آزمایش RT-PCR، قسمتی از منطقه غیر قابل ترجمه ناحیه ‌‌'5 ‌ویروس به طول 249 جفت باز تکثیر شد. محصول PCR در وکتور R/T57pTZ کلون گردید و نتیجه تعیین ردیف اسیدهای نوکلوتیدی آن اختصاصی بودن آزمایش را تایید نمود. سپس پرایمرهای داخلی انتخاب و آزمایش Nested-PCR ‌انجام گردید و یک قطعه DNA ‌به طول 155 جفت باز تکث...

full text

مروری بر روش های تشخیص آزمایشگاهی ویروس هپاتیت C

ویروس هپاتیت سی (HCV)باعث ایجاد بیماری های هپاتیت حاد،سیروز کبدی و هپاتوسلولار کارسینوما می شود.در این مقاله به طور خلاصه به بیماری زایی و بررسی روش های تشخیصی بر پایه تست های سرولوژیکی و تکنیک های مولکولی برای تشخیص و مدیریت عفونت ویروس هپاتیت سی بررسی می شود. پس از خواندن این مقاله باید بتوانید تست های آزمایشگاهی که برای تشخیص و مدیریت ویروس هپاتیت سی استفاده می شود را توصیف کنید و در ت...

full text

به‏کارگیری روش semi nested-pcr-rflp برای تشخیص و تعیین ژنوتیپ gb ویروس c در بین افراد آلوده به عفونت ویروس هپاتیت b

هدف: gb ویروس c جزء ویروس‏های منتقل شونده از راه خون، فرآورده‏های خونی و از طریق جنسی است و از آن‏جا که راه انتقال آن با ویروس‏های عامل هپاتیت مشترک است، طی این مطالعه ویروس را در بین افراد hbsag مثبت با روش حساس‏تر semi nested-pcr جداسازی کرده و ژنوتیپ‏های ویروس با روش rflp تعیین شد. مواد و روش‏ها: در تحقیقی که به‏صورت مقطعی بین سال‏های 1389 تا 1390، روی 100 نمونه سرمی افراد hbsag مثبت انجام ش...

full text

استفاده از روش nested-pcr برای تشخیص آلودگی کشت های سلولی به ویروس pestivirus

در این مطالعه یک روش nested-pcr برای تشخیص دو ویروس bvdv از سویه nadl بهینه سازی گردید. در آزمایش rt-pcr، قسمتی از منطقه غیر قابل ترجمه ناحیه '5 ویروس به طول 249 جفت باز تکثیر شد. محصول pcr در وکتور r/t57ptz کلون گردید و نتیجه تعیین ردیف اسیدهای نوکلوتیدی آن اختصاصی بودن آزمایش را تایید نمود. سپس پرایمرهای داخلی انتخاب و آزمایش nested-pcr انجام گردید و یک قطعه dna به طول 155 جفت باز تکثیر شد. م...

full text

ساخت اینترنال کنترل تشخیص مولکولی ویروس هپاتیت B به روش PCR-Cloning

سابقه و هدف: در تشخیص هپاتیت ناشی از ویروس هپاتیت B (HBV )، بکارگیری تکنیک های آزمایشگاهی حساس و اختصاصی همچون PCR ضروری است. روشهای سرولوژیکی موجود، قابلیت تشخیص سریع و دقیق آلودگی را نداشته درحالیکه روشهای نوین مولکولی مانند PCR ابزار کارآمدی برای ارزیابی میزان شیوع HBV می باشد. بروز نتایج متفاوت در آزمایشگاهها بدلیل استاندارد نبودن از معایب این تکنیک مولکولی قوی است. یکی از مهم ترین موانع در...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
پژوهش های آسیب شناسی زیستی

جلد ۱۰، شماره Summer ۲۰۰۸، صفحات ۳۵-۴۱

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023